Экспертиза показала, что один из фрагментов лепной розетки в центре купола в виде лепестка отошел от основы. В Смольном принято решение о проведении первоочередных противоаварийных работ. За последние 13 лет из средств бюджета Санкт-Петербурга на реставрацию здания мечети было выделено более 70 миллионов рублей: проведена реставрация гранитной облицовки западного и южного фасадов, майолики и металлических дверей западного портала, реставрация майолики северного и восточного порталов, капитальный ремонт крыши, частичный реставрационный ремонт Большого купола.
С 2013 года ведутся работы по реставрации минаретов. К настоящему времени завершены работы по реставрации их гранитной облицовки, в 2015 году планируется завершение реставрации майоликовой облицовки.